ההבדל המהותי ביותר הין שני סוגי החלקות השיער הוא עומק חדירת החומר המחליק את תוך גוף השערה. כשמדובר בהחלקה יפנית, חומר ההחלקה חודר אל תוך עומק השערה ומשנה את מבנה השערה לצמיתות (למרות ששיער חדש שיגדל לא ישתנה וישאר כפי שהיה כי ההחלקה אינה משנה את שורשי השיער), בעוד שבהחלקה ברזילאית מדובר בחומר החודר לשכבה הראשונה של השערה (שכבת הקשקש) ומזין אותה בחומרים ומינרלים שונים (למשל קראטין) המחליקים את השיער יחד עם טיפול במיישר שיער קרמי ייחודי.

בכל מקרה שתי ההחלקות מצריכות טיפולי המשך לאחר מספר חודשים אם רוצים לשמור על מראה שיער חלק. ההחלקה הברזילאית מכילה בתוכה מרכיב טיפולי ומחדשת את השיער כך שיהיה לו מראה חיוני ומלא ברק.

מבחינת אורך התהליך, תהליך ההחלקה הברזילאית קצר הרבה יותר מאשר תהליך ההחלקה היפנית, אולם יש לזכור כי לאחר הטיפול עצמו, החלקה יפנית מחזיקה מעמד זמן רב יותר ותכיפות הטיפולים נמוכה ביחס להחלקה ברזילאית
הפרסום הגדול בארץ וכל שלל מוצרי פרסום הקיימים בתחום החלקות השיער בדרך כלל מצביעים על החלקה יפנית כהחלקת שיער המועדפת למרות שאין הדבר כך כלל. הכל תלוי בדרישות הלקוח וסוג השיער, מה גם שיש לזכור כי החלקה ברזילאית היא בעלת אופי טיפולי ואפילו ניתן לומר חיובית לשיער עצמו.